Kiedy Naruto po raz pierwszy stworzył Rasen-Shuriken, technika była tylko w połowie ukończona. Nie była wystarczająco stabilna, aby można było nią rzucać, więc Naruto musiał używać jej jako ataku wręcz, tak jak standardowego Rasengana. Jednak odrzut tego jutsu jest niezwykle niebezpieczny.
Kiedy Rasen-Shuriken uderza, rozpływa się w istną armadę mikroskopijnych łopat wiatru, które atakują każdą komórkę ciała przeciwnika, przerywając sieć Chakry ofiary. Jednakże, ze względu na bliskość punktu uderzenia, Naruto doświadcza podobnych efektów ubocznych w ramieniu, które wykonało technikę. Mimo, że uszkodzenia sieci Chakry nie były tak poważne, nadużywanie tej techniki uczyniłoby Naruto na stałe niezdolnym do formowania Chakry.
Jednakże, po tym jak Naruto nauczył się wchodzić w Tryb Mędrca, może użyć Mędrca Chakry do ustabilizowania formy Jutsu, pozwalając na rzucenie go jak prawdziwego shurikena. Jest to również prawdziwe, gdy Naruto zyskuje kontrolę nad Chakrą Dziewięciu Ogonów.
Jako technika dalekiego zasięgu, Rasen-Shuriken nie stanowi już żadnego zagrożenia dla Naruto.